Akceptuję
W ramach naszej witryny stosujemy pliki cookies w celu świadczenia państwu usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczone w Państwa urządzeniu końcowym. Możecie Państwo dokonać w każdym czasie zmiany ustawień dotyczących cookies. Więcej szczegółów w naszej Polityce Prywatności

Zamknij X

Naukowy styl życia

Nauka i biznes

Strona główna Informacje
Dodatkowy u góry

Polka rozszyfrowuje epigenom białaczki

Analiza epigenomu 140 pacjentów chorych na przewlekłą białaczkę limfatyczną (ang. chronic lymphocitic leukemia, CLL) pozwoliła na zidentyfikowanie komórek, które zapoczątkowują tę chorobę oraz wskazanie nowych mechanizmów związanych z jej rozwojem. Dzięki tym badaniom zaproponowano nowe podejście diagnostyczne, mogące udoskonalić leczenie tego nowotworu.

Badania, opublikowane 14.10.2012 r. przez renomowane czasopismo Nature Genetics zostały zrealizowane pod kierunkiem Iñaki Martin-Subero z Uniwersytetu w Barcelonie, a jedną z głównych autorek pracy badawczej jest Marta Kuliś, polska studentka, realizująca pracę doktorską w Hiszpanii. Jest to pierwszy owoc współpracy dwóch międzynarodowych projektów badawczych: hiszpańskiego konsorcjum CLL Genome Project, wchodzącego w skład Międzynarodowego Konsorcjum Genomu Raka (ang. International Cancer Genome Consortium, ICGC) oraz europejskiego projektu BLUEPRINT, związanego z International Human Epiegenome Consortium. BLUEPRINT jest projektem prowadzonym pod egidą Komisji Europejskiej, którego celem jest zsekwencjonowanie epigenomu zdrowych i nowotworowych komórek krwi.

W przedsięwzięciu, którego koszt szacuje się na 30 milionów euro, uczestniczy ponad 50 czołowych badaczy z 41 instytucji z całej Europy. Hiszpański CLL Genome Project ma przybliżyć mechanizmy rozwoju przewlekłej białaczki limfatycznej, jednej z najczęstszych typów białaczki dotykających głównie osoby po 50 roku życia. Projekt ten jest jednym z 47 wchodzących w skład zawiązanego w 2008 roku Międzynarodowego Konsorcjum Genomu Raka, mającego za zadanie identyfikację i analizę zmian molekularnych zachodzących w 50 typach najczęściej występujących nowotworów.

Dotychczasowe badania nad przewlekłą białaczką limfatyczną skupiały się na analizie mutacji DNA. W najnowszej pracy Marta Kuliś wspólnie z 41 naukowcami z całej Europy, prezentuje nowe podejście łączące dane z sekwencjonowania nie tylko całego genomu, ale i epigenomu pacjentów, co daje kompleksowy obraz rozwoju choroby. „Ludzki genom można określić jako składnicę informacji, podczas gdy epigenom jest potrzebny do jej prawidłowego odczytania. Innymi słowy mechanizmy epigenetyczne pozwalają na aktywowanie lub wyciszanie genów, których sekwencja zapisana jest w genomie” - tłumaczy Iñaki Martin-Subero. O ile poprzednie analizy zidentyfikowały „tylko” około 1000 genów zmutowanych w przewlekłej białaczce limfatycznej, najnowsze wyniki wskazują na obecność aż ponad miliona zmian epigenetycznych w komórkach chorych osób. Świadczy to zatem o tym, że w komórkach rakowych dochodzi do rozregulowania mechanizmów epigentycznych na dużo większą skalę niż dotychczas sądzono.

Uzyskane wyniki były możliwe dzięki zastosowaniu najnowszych technologii sekwencjonowania oraz użyciu mikromacierzy analizujących poziomu metylacji DNA - jednej z modyfikacji epigenetycznych. „Do tej pory większość badań ograniczyło się do analizy wyłącznie tych regionów DNA, które uważano za najbardziej istotne w ekspresji genów. My postanowiliśmy przyjrzeć się całości materiału genetycznego i ku naszemu zdumieniu okazało się, że najwięcej zmian epigenetycznych w CLL powstaje w niezbadanych dotąd regionach” - mówi Marta Kuliś. Co ciekawe, to odkrycie jest w pewien sposób uzupełnieniem opublikowanych kilka tygodni wcześniej wyników ENCODE Project, które wskazują, że fragmenty DNA uważane dotąd za „śmieciowe” i nieistotne, w rzeczywistości zawierają sekwencje regulujące aktywność genów. „Z zaskoczeniem spostrzegliśmy, że większość zmian epigentycznych w komórkach nowotworowych zachodzi właśnie w regionach opisanych w publikacji ENCODE. Być może jest to wytyczna dla przyszłych badań naukowców, aby dokładniej przyjrzeć się tym sekwencjom, bo w nich może tkwić klucz do zrozumienia nowych mechanizmów komórkowych” - dodaje Iñaki Martin-Subero.

Źródło: www.e-biotechnologia.pl







Tagi: białaczka, lab, laboratorium, epigenom, badania, projekt, nowotwór, diagnostyka, gen, krew
Drukuj PDF
wstecz Podziel się ze znajomymi

Recenzje




Fosfor z wód ściekowych
23-01-2017

Fosfor z wód ściekowych

Badacze z konsorcjum finansowanego przez UE opracowali nowe metody odzyskiwania fosforu do celów rolniczych ze ścieków komunalnych.

Ćwiczenia obniżają stan zapalny
23-01-2017

Ćwiczenia obniżają stan zapalny

Wystarczy 20 minut umiarkowanych ćwiczeń, by przyhamować produkcję cytokin prozapalnych i obniżyć stan zapalny organizmu.

Czekają nas kolejne epidemie
23-01-2017

Czekają nas kolejne epidemie

Po epidemii wywołanej przez Ebolę oraz wirusa Zika przewiduje się, że najbardziej prawdopodobne jest rozprzestrzenienie się trzech kolejnych mało wciąż znanych patogenów.

Znaczenie i zastosowanie analizy próbki moczu
23-01-2017

Znaczenie i zastosowanie analizy próbki moczu

Jednym z najczęściej wykorzystywanych materiałów biologicznych w oznaczeniach laboratoryjnych jest mocz. Jako materiał analityczny stosowany jest mocz z tzw. zbiórki porannej.

znajdz nas na fcb
Informacje dnia: Fosfor z wód ściekowych Ćwiczenia obniżają stan zapalny Testy DNA pozwalają określić zdolności dzieci Konkurs Synthos Chemical Award - bez rozstrzygnięcia Targi EuroLab - wszystko dla laboratoriów Czekają nas kolejne epidemie Fosfor z wód ściekowych Ćwiczenia obniżają stan zapalny Testy DNA pozwalają określić zdolności dzieci Konkurs Synthos Chemical Award - bez rozstrzygnięcia Targi EuroLab - wszystko dla laboratoriów Czekają nas kolejne epidemie Fosfor z wód ściekowych Ćwiczenia obniżają stan zapalny Testy DNA pozwalają określić zdolności dzieci Konkurs Synthos Chemical Award - bez rozstrzygnięcia Targi EuroLab - wszystko dla laboratoriów Czekają nas kolejne epidemie

Partnerzy

GoldenLine Fundacja Kobiety Nauki Warszawskie Stowarzyszenie Biotechnologiczne (WSB) „Symbioza” Obywatele Nauki NeuroSkoki Biomantis Uni Gdansk MULTITRAIN I MULTITRAIN II Nauki przyrodnicze KOŁO INZYNIERÓW PB ICHF PAN FUNDACJA JWP NEURONAUKA BIOOPEN 2016 QDAY Mlodym Okiem Nanotechnologia Lodz Nauka w Polsce CITTRU - Centrum Innowacji, Transferu Technologii i Rozwoju Uniwersytetu Akademia PAN Chemia i Biznes Farmacom Świat Chemii Forum Akademickie Biotechnologia     Geodezja „Pomiędzy naukami – zjazd fizyków i chemików” WIMC WARSZAWA 2016 Konferencja Biomedyczna Projektor Jagielloński Instytut Lotnictwa EuroLab