Metagenom zsekwencjonowany
Osoby z obniżoną odpornością, np. chorzy na AIDS lub osoby będące po przeszczepie, są szczególnie zagrożone tzw. pneumocystozą, czyli bardzo groźnym zakażeniem grzybowym. Jak dotąd jednak bardzo mało jest wiadomo na temat biologii i patogeniczności wywołującego je mikroorganizmu, czyli grzyba Pneumocystis jirovecii. Przyczyną owej niewiedzy jest fakt, że nie opracowano jeszcze metody jego izolacji i hodowli w laboratorium.
Problem ten rozwiązano niedawno wykorzystując tzw. popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, czyli inaczej sól fizjologiczną podaną odoskrzelowo pacjentowi z pneumocystozą. Dzięki temu uzyskano komórki P. jirovecii, które następnie skoncentrowano za pomocą immunoprecypitacji, a wykorzystując technikę losowej amplifikacji DNA stworzono kopie zawartego w nich materiału genetycznego. Jest to pierwszy przypadek, złączenia w kompletny genom tzw. metagenomu, czyli sekwencji DNA znajdujących się w jednym środowisku.
Dzięki tym badaniom wykazano, że P. jirovecii nie jest w stanie przeżyć poza ludzkim organizmem i nie wykazuje zdolności do produkcji toksyn oraz czynników wirulencji pozwalających mikrobom atakować zdrowego gospodarza. Odkrycie to tłumaczy zatem dlaczego tego typu infekcje zdarzają się jedynie u osłabionych osób i stanowi bardzo cenną informację zarówno dla lekarzy jak i dla naukowców zajmujących się tym zagadnieniem.
Źródło: www.e-biotechnologia.pl
Problem ten rozwiązano niedawno wykorzystując tzw. popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, czyli inaczej sól fizjologiczną podaną odoskrzelowo pacjentowi z pneumocystozą. Dzięki temu uzyskano komórki P. jirovecii, które następnie skoncentrowano za pomocą immunoprecypitacji, a wykorzystując technikę losowej amplifikacji DNA stworzono kopie zawartego w nich materiału genetycznego. Jest to pierwszy przypadek, złączenia w kompletny genom tzw. metagenomu, czyli sekwencji DNA znajdujących się w jednym środowisku.Dzięki tym badaniom wykazano, że P. jirovecii nie jest w stanie przeżyć poza ludzkim organizmem i nie wykazuje zdolności do produkcji toksyn oraz czynników wirulencji pozwalających mikrobom atakować zdrowego gospodarza. Odkrycie to tłumaczy zatem dlaczego tego typu infekcje zdarzają się jedynie u osłabionych osób i stanowi bardzo cenną informację zarówno dla lekarzy jak i dla naukowców zajmujących się tym zagadnieniem.
Źródło: www.e-biotechnologia.pl
Tagi: pneumocystoza, metagenom, DNA, lab, laboratorium, laboratoria
wstecz Podziel się ze znajomymi
30-03-2026
Doktor z TikToka: fajnie by było, gdyby w sieci to jednak naukowcy...
Aby chronić pisklęta przed pasożytami.
30-03-2026
Duże teleskopy sfotografowały dwie formujące się planety
Ogłosiło Europejskie Obserwatorium Południowe (ESO).
30-03-2026
Bakteriofagi mogą chronić żywność przed salmonellą
Informuje pismo „Applied and Environmental Microbiology”.
30-03-2026
Rękawiczki mogą zawyżać wyniki pomiarów mikroplastiku
Informuje specjalistyczne pismo „Analytical Methods”.
Recenzje