Akceptuję
W ramach naszej witryny stosujemy pliki cookies w celu świadczenia państwu usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczone w Państwa urządzeniu końcowym. Możecie Państwo dokonać w każdym czasie zmiany ustawień dotyczących cookies. Więcej szczegółów w naszej Polityce Prywatności

Zamknij X
BioSzkolenia

Naukowy styl życia

Nauka i biznes

Strona główna Informacje
Dodatkowy na dole

Dodatkowy na dole

Gąbki jako źródło bakterii przeciwdrobnoustrojowych


Farmakolodzy mają obecnie dwa ważne zadania – znalezienie nowych związków chemicznych, które mogłyby być stosowane w leczeniu raka, oraz identyfikacja bakterii o potencjale przeciwdrobnoustrojowym. Naukowcy zainteresowali się obecnie organizmami morskimi, aby sprawdzić, co mają one do zaoferowania.


Oporność na antybiotyki i nowe sposoby leczenia guzów nowotworowych stanowią dwa kluczowe wyzwania stojące przed naukowcami zajmujących się różnymi dyscyplinami. Badania nad związkami molekularnymi z otaczających nas organizmów są już prowadzone, a obecnie naukowcy postanowili zająć się życiem pod wodą.

Zespół finansowanego ze środków UE projektu BluePharmTrain skupiał się na gąbkach morskich, ponieważ są one najbogatszym oceanicznych źródłem rozmaitych związków chemicznych. Odkryto wiele interesujących cząsteczek, ale jak dotąd nie znaleziono odpowiedniego sposobu, aby je pozyskiwać w dużych ilościach.

Zbadanie ich ogromnego potencjału jest trudne, ponieważ zazwyczaj brakuje materiału nawet do rozpoczęcia badań klinicznych. Celem projektu było zatem rozwiązanie problemu tego wąskiego gardła.

Podwodne bogactwo farmakologiczne

Morskie gąbki zawierają niezwykle różnorodne populacje drobnoustrojów i są światowymi rekordzistami pod względem wytwarzania cząsteczek bioaktywnych. Wcześniejsze badania ukierunkowane na rozwój gąbek lub związanych z nimi drobnoustrojów w celu wytwarzania związków bioaktywnych na potrzeby zapewnienia materiału biologicznego do badań klinicznych w dużej mierze kończyły się niepowodzeniem.

„Innowacyjność naszego projektu polegała na tym, że zintegrowaliśmy rewolucyjne techniki sekwencjonowania DNA”, mówi koordynator projektu, dr Detmer Sipkem, z Uniwersytetu Wageningen w Holandii.

Jak tłumaczy dr Sipkema, ostatnie koncepcyjne i technologiczne odkrycia w dziedzinie genomiki, transkryptomiki i proteomiki („omika”) zmieniły sposób postrzegania genów, gatunków i społeczności. Te innowacje mają również wpływ na inne dziedziny, takie jak ekologia i biotechnologia. Przedstawiają „stare problemy” w nowym świetle i pozwalają badaczom wyjść poza wcześniejsze ograniczenia.

Zespół projektu BluePharmTrain wykorzystał te innowacyjne podejścia, aby uzyskać lepszy obraz fizjologicznych reakcji gąbek w ich naturalnym środowisku, w tym ich reakcji na stres, np. związany ze zmianą temperatury. Naukowcom szczególnie zależało na zbadaniu symbiontów bakterii, których obecnie nie można hodować, w celu ustalenia wysoce dopasowanych metod hodowli tych bakterii.

„Poszukiwaliśmy wolno żyjących bakterii, które zawierają klastry genów najbardziej zbliżone do tych wykrytych w gąbkach”, mówi dr Sipkema.

Znalezienie gąbek i „utrwalenie” ich w celu zapewnienia ich stabilności było prostym zadaniem: zespół zbierał gąbki i przekazywał je kolegom oczekującym z utrwalaczem. Następnie wyekstrahowano DNA i RNA.

„Uzyskaliśmy bardzo mieszane wyniki, które przypominały zbiór przypadkowych elementów różnych układanek”. Poprzez wykorzystanie wysoce zaawansowanego oprogramowania dr Sipkema i jego zespół zdołali jednak zinterpretować większość danych. „Dało nam to wgląd w genomy najpowszechniej występujących obfitych symbiotycznych bakterii (które są prawdziwymi producentami większości cząsteczek) i pozwoliło zidentyfikować gospodarza klastrów genów kodujących pożądane cząsteczki”.

Nowe możliwości w zakresie leczenia farmakologicznego

Po rozszyfrowaniu tych łamigłówek zespół projektu zyskał nowe informacje na temat cech metabolizmu bakterii. Jak mówi dr Sipkema: „Przykładowo teraz wiemy więcej o bakteriach odpowiedzialnych za produkcję terpenów z wykorzystaniem tiocyjanianów (które mają właściwości przeciwdrobnoustrojowe)”. Zespół ustalił również, co może być potrzebne do wyizolowania glikoprotein i glikolipidów obecnych w powszechnie występujących symbiontach gąbkowych.

Korzystając z analizy bioinformatycznej, partnerzy projektu zdołali wyśledzić wolno żyjącą bakterię, która wytwarza związek bardzo zbliżony do politeonamidu. Politeonamidy to wysoce cytotoksyczne cząsteczki wytwarzane przez, jak odkrył zespół projektu, symbiotyczne bakterie pochodzące z gąbki Theonella swinhoei. Naukowcom udało się genetycznie zmodyfikować tę wolno żyjącą bakterię, aby umożliwić wytwarzanie różnych cząsteczek podobnych do politeonamidu o różnych właściwościach farmakologicznych.

Korzystny wpływ projektu

Dr Sipkema ma pewność, że współpraca ponad granicami miała bardzo korzystny wpływ na jego badania. „Sieć naprawdę działała jako zespół. Nawiązano bardzo silne partnerstwa w celu prowadzenia badań, których partnerzy nie byliby w stanie zrealizować samodzielnie. Dzięki temu działaliśmy szybciej i wydajniej rozporządzaliśmy funduszami na badania”, mówi.

„Współpraca nawiązana w trakcie projektu jest i będzie kontynuowana przez jakiś czas. Chciałbym wykorzystać powstałą sieć i iść dalej, jednocześnie czerpiąc korzyści z opracowanego programu szkoleniowego i wspaniałego ducha współpracy”, mówi dr Sipkema.

Źródło: www.cordis.europa.eu




Drukuj PDF
wstecz Podziel się ze znajomymi

Recenzje




Informacje dnia: Smog - kilka zasad jak z nim walczyć Stres i ból głowy – jak się uporać? Aerozol z e-papierosów negatywnie wpływa na czynność płuc 16 % polskich internautów odczuwa lęk przed odłączeniem od Internetu Operacje robotyczne stają się światowym standardem Leczenie przeziębień ogólnie mało skuteczne Smog - kilka zasad jak z nim walczyć Stres i ból głowy – jak się uporać? Aerozol z e-papierosów negatywnie wpływa na czynność płuc 16 % polskich internautów odczuwa lęk przed odłączeniem od Internetu Operacje robotyczne stają się światowym standardem Leczenie przeziębień ogólnie mało skuteczne Smog - kilka zasad jak z nim walczyć Stres i ból głowy – jak się uporać? Aerozol z e-papierosów negatywnie wpływa na czynność płuc 16 % polskich internautów odczuwa lęk przed odłączeniem od Internetu Operacje robotyczne stają się światowym standardem Leczenie przeziębień ogólnie mało skuteczne

Partnerzy

GoldenLine Fundacja Kobiety Nauki Job24 Obywatele Nauki NeuroSkoki Portal MaterialyInzynierskie.pl Uni Gdansk MULTITRAIN I MULTITRAIN II Nauki przyrodnicze KOŁO INZYNIERÓW PB ICHF PAN FUNDACJA JWP NEURONAUKA Mlodym Okiem Polski Instytut Rozwoju Biznesu Analityka Nauka w Polsce CITTRU - Centrum Innowacji, Transferu Technologii i Rozwoju Uniwersytetu Akademia PAN Chemia i Biznes Farmacom Świat Chemii Forum Akademickie Biotechnologia     Geodezja Instytut Lotnictwa EuroLab

Szanowny Czytelniku!

 
25 maja 2018 roku zacznie obowiązywać Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r (RODO). Potrzebujemy Twojej zgody na przetwarzanie Twoich danych osobowych przechowywanych w plikach cookies. Poniżej znajdziesz pełny zakres informacji na ten temat.
 
Zgadzam się na przechowywanie na urządzeniu, z którego korzystam tzw. plików cookies oraz na przetwarzanie moich danych osobowych pozostawianych w czasie korzystania przeze mnie ze strony internetowej Laboratoria.net w celach marketingowych, w tym na profilowanie i w celach analitycznych.

Kto będzie administratorem Twoich danych?

Administratorami Twoich danych będziemy my: Portal Laboratoria.net z siedzibą w Krakowie (Grupa INTS ul. Czerwone Maki 55/25 30-392 Kraków).

O jakich danych mówimy?

Chodzi o dane osobowe, które są zbierane w ramach korzystania przez Ciebie z naszych usług w tym zapisywanych w plikach cookies.

Dlaczego chcemy przetwarzać Twoje dane?

Przetwarzamy te dane w celach opisanych w polityce prywatności, między innymi aby:

Komu możemy przekazać dane?

Zgodnie z obowiązującym prawem Twoje dane możemy przekazywać podmiotom przetwarzającym je na nasze zlecenie, np. agencjom marketingowym, podwykonawcom naszych usług oraz podmiotom uprawnionym do uzyskania danych na podstawie obowiązującego prawa np. sądom lub organom ścigania – oczywiście tylko gdy wystąpią z żądaniem w oparciu o stosowną podstawę prawną.

Jakie masz prawa w stosunku do Twoich danych?

Masz między innymi prawo do żądania dostępu do danych, sprostowania, usunięcia lub ograniczenia ich przetwarzania. Możesz także wycofać zgodę na przetwarzanie danych osobowych, zgłosić sprzeciw oraz skorzystać z innych praw.

Jakie są podstawy prawne przetwarzania Twoich danych?

Każde przetwarzanie Twoich danych musi być oparte na właściwej, zgodnej z obowiązującymi przepisami, podstawie prawnej. Podstawą prawną przetwarzania Twoich danych w celu świadczenia usług, w tym dopasowywania ich do Twoich zainteresowań, analizowania ich i udoskonalania oraz zapewniania ich bezpieczeństwa jest niezbędność do wykonania umów o ich świadczenie (tymi umowami są zazwyczaj regulaminy lub podobne dokumenty dostępne w usługach, z których korzystasz). Taką podstawą prawną dla pomiarów statystycznych i marketingu własnego administratorów jest tzw. uzasadniony interes administratora. Przetwarzanie Twoich danych w celach marketingowych podmiotów trzecich będzie odbywać się na podstawie Twojej dobrowolnej zgody.

Dlatego też proszę zaznacz przycisk "zgadzam się" jeżeli zgadzasz się na przetwarzanie Twoich danych osobowych zbieranych w ramach korzystania przez ze mnie z portalu *Laboratoria.net, udostępnianych zarówno w wersji "desktop", jak i "mobile", w tym także zbieranych w tzw. plikach cookies. Wyrażenie zgody jest dobrowolne i możesz ją w dowolnym momencie wycofać.
 
Więcej w naszej POLITYCE PRYWATNOŚCI
 

Newsletter

Zawsze aktualne informacje