Zalety metody ''górnictwa genomowego''
Żywe organizmy są niewyczerpanym źródłem różnych związków chemicznych, które mogą być przydatne dla człowieka, chociażby jako potencjalne leki (jak np. w przypadku antybiotyku penicyliny). Jednak wykrywanie nowych substancji chemicznych i ich izolowanie z komórek jest często bardzo pracochłonne i kosztowne.
Grupa brytyjskich naukowców z University of Warwick z Coventry pod kierunkiem Gregory'ego L. Challisa opracowała nową metodę poszukiwania białek i innych związków chemicznych. Metodę nazwali "górnictwem genomowym" (ang. genetic mining), gdyż polega ona na "przekopywaniu się" przez sekwencje DNA i przewidywaniu na ich podstawie obecności i właściwości kodowanych przez nie białek.
Brytyjscy naukowcy przebadali w ten sposób genom bakterii Streptomyces coelicolor i zidentyfikowali skupiska genów, kodujących białka, dzięki czemu przewidzieli obecność w komórkach bakteryjnych nieznanego dotąd białka coelicheliny.
Następnie, dzięki znajomości sekwencji, badacze mogli łatwo wyizolować białko coelichelinę z komórek bakteryjnych.
Dalsze badania strukturalne wykazały, że białko to jest tetrapeptydem (składa się z czterech mniejszych białek) i pełni ważną rolę w wiązaniu jonów żelaza przez bakterię, szczególnie w warunkach niskiego stężenia żelaza w otoczeniu.
Wydaje się, że metoda "górnictwa genomowego" pomoże w szybszym wykrywaniu nowych naturalnych substancji chemicznych, z których część może być potencjalnymi lekami.
PAP
Skomentuj na forum
https://laboratoria.net/home/9846.html