Akceptuję
W ramach naszej witryny stosujemy pliki cookies w celu świadczenia państwu usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczone w Państwa urządzeniu końcowym. Możecie Państwo dokonać w każdym czasie zmiany ustawień dotyczących cookies. Więcej szczegółów w naszej Polityce Prywatności

Zamknij X
Kielce
Strona główna Tygodnik "Nature"
Dodatkowy na dole

Największe na świecie drzewo genealogiczne

Wykorzystując dane z stron internetowych poświęconych genealogii, pewien uznany „haker” skonstruował prawdopodobnie największe w historii drzewo genealogiczne. Naukowiec planuje teraz wykorzystać zgromadzone dane, w tym gigantyczny rodowód łączący życia 13 milionów ludzi i sięgający wstecz do XV wieku, aby zbadać dziedziczenie niektórych skomplikowanych cech genetycznych, takich jak długowieczność czy płodność.

Oprócz możliwości zorganizowania największego w dziejach zjazdu rodzinnego, praca biologa obliczeniowego, Yaniva Erlicha, zaprezentowana na corocznym zebraniu członków American Society of Human Genetics w Bostonie, może pomóc zrozumieć wpływ genów na występowanie pewnych cech. Rodowody zostały udostępnione innym naukowcom, jednak Erlich i jego współpracownicy utajnili występujące w nich nazwiska dla ochrony prywatności ich posiadaczy.

„Sama struktura drzewa może wnieść sporo ciekawych informacji na temat demografii i ekspansji terytorialnej ludzi”, mówi Nancy Cox, genetyk z University of Chicago, Illinois, która nie uczestniczyła w badaniach. Twierdzi ona też, że informacje może dać się połączyć z danymi medycznymi i genetycznymi, które coraz więcej osób udostępnia w publicznych bazach. „Tak naprawdę dopiero zaczęliśmy odkrywać, co takie rodowody mogą wnieść do naszej wiedzy”, mówi Cox.

Zapuszczając korzenie

Rodowody dostarczają wskazówek na temat dziedziczności genetycznej. Dla przykładu, porównywanie jednostki do jej dalszych krewnych oraz stwierdzenie zmian w częstotliwości występowania jakiejś cechy, może pomóc ustalić, na ile cecha ta ma korzenie w genach. Może co więcej dać obraz tego, czy dana cecha jest kontrolowana przez kilka, lecz znaczących genów, czy raczej przez dużą ilość genów o małym znaczeniu, które połączone ze sobą przyczyniają się do jej powstawania.

Zbieranie danych od chociażby kilku tysięcy osób trwa całe lata, mówił Erlich podczas prezentacji 24 października. W przeszłości naukowcy żmudnie zdobywali te informacje z archiwów kościelnych lub od ochotników. Erlich i jego koledzy postanowili ominąć ten proces zbierając dane z portalu geni.com, na którym publiczne konta mają 43 miliony użytkowników. Profile zwykle zawierały datę urodzin (i śmierci) oraz lokalizację.

Ekipa skonstruowała drzewa rodzinne o rozmiarze od kilku tysięcy aż do 13 milionów osób. Erlich mówi, że wcześniejsze rodowody obejmowały w najlepszym wypadku setki tysięcy ludzi.

Lisa Cannon-Albright, genetyk z Uniwersytetu Utah w Salt Lake City, zaleca ostrożność przy wykorzystywaniu których prawdziwość nie jest weryfikowana. Pracowała już na danych z wielkiej bazy uniwersyteckiej połączonej z informacjami medycznymi. „Każdy chce znaleźć wśród swoich przodków członków rodziny królewskiej”, mówi Albright. „W tak ogromnych rodowodach nie należy traktować poważnie danych sprzed wielu wieków”. Sama za taką granicę uważa rok 1500.

Ostatecznie wartością rodowodu są informacje, jakie można z niego „wydobyć”. Na tym samym spotkaniu w Bostonie, Albright zaprezentowała dane z bazy Utah, które sugerowały, że chromosom Y przekazywany z ojca na syna może przenosić czynniki ryzyka zachorowania na raka prostaty. Rozpoczęła też ostatnio program mający na celu połączenie danych genealogicznych z medycznymi pochodzącymi z Veterans Health Administration.

deCODE, firma zajmująca się genetyką z siedzibą Reykjaviku,  wykorzystała obszerną bazę danych w poszukiwaniu genetycznych kluczy, wpływających na różne cechy, w tym choroby. Poznanie struktury populacji Islandii pomogło zdecydować, które próbki powinny być włączone do badań. „To niezwykle obiecujące podejście”, ocenia założyciel firmy, Karl Stefansson, który prześledził historię swojej rodziny, odnajdując jej początek w 910 roku w osobie słynącego z brzydoty poety i wojownika.

Na razie nie wiadomo, czy olbrzymie drzewa zbudowane przez Erlicha odniosą sukces. Niektórzy badacze obecni na spotkaniu wyrazili spory entuzjazm dla projektu, jednak przyparto ich do muru żądając podania konkretnego pomysłu eksperymentu wykorzystującego zdobyte dane.

Stefansson jest jednak przekonany, że genealogia będzie w przyszłości odgrywała dużą rolę w genetyce. „Ludzie coraz chętniej uczestniczą w takich eksperymentach i udostępniają swoje dane. To rodzi ekscytujące możliwości”.

Autor: Katarzyna Chrząszcz

Zdjecie: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Stammbaum_Bluntschli.jpg


Tagi: drzewo genealogiczne, lab, laboratorium, cecha, genetyka, dziedzicznosc
Drukuj PDF
wstecz Podziel się ze znajomymi

Informacje dnia: Nagroda NCN zostanie wręczona po raz szósty Aspiryna na serce nie dla każdego Czujnik optyczny wykrywa sepsę w pół godziny Przełom w diagnostyce kardiologicznej Drukowane ogniwa słoneczne rewolucjonizują produkcję elektroniki Egzoszkielety pomagają uzyskać nadludzkie siły Nagroda NCN zostanie wręczona po raz szósty Aspiryna na serce nie dla każdego Czujnik optyczny wykrywa sepsę w pół godziny Przełom w diagnostyce kardiologicznej Drukowane ogniwa słoneczne rewolucjonizują produkcję elektroniki Egzoszkielety pomagają uzyskać nadludzkie siły Nagroda NCN zostanie wręczona po raz szósty Aspiryna na serce nie dla każdego Czujnik optyczny wykrywa sepsę w pół godziny Przełom w diagnostyce kardiologicznej Drukowane ogniwa słoneczne rewolucjonizują produkcję elektroniki Egzoszkielety pomagają uzyskać nadludzkie siły

Partnerzy

GoldenLine Fundacja Kobiety Nauki Job24 Obywatele Nauki NeuroSkoki Portal MaterialyInzynierskie.pl Uni Gdansk MULTITRAIN I MULTITRAIN II Nauki przyrodnicze KOŁO INZYNIERÓW PB ICHF PAN FUNDACJA JWP NEURONAUKA Mlodym Okiem Polski Instytut Rozwoju Biznesu Analityka Nauka w Polsce CITTRU - Centrum Innowacji, Transferu Technologii i Rozwoju Uniwersytetu Akademia PAN Chemia i Biznes Farmacom Świat Chemii Forum Akademickie Biotechnologia     Geodezja Instytut Lotnictwa EuroLab

Szanowny Czytelniku!

 
25 maja 2018 roku zacznie obowiązywać Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r (RODO). Potrzebujemy Twojej zgody na przetwarzanie Twoich danych osobowych przechowywanych w plikach cookies. Poniżej znajdziesz pełny zakres informacji na ten temat.
 
Zgadzam się na przechowywanie na urządzeniu, z którego korzystam tzw. plików cookies oraz na przetwarzanie moich danych osobowych pozostawianych w czasie korzystania przeze mnie ze strony internetowej Laboratoria.net w celach marketingowych, w tym na profilowanie i w celach analitycznych.

Kto będzie administratorem Twoich danych?

Administratorami Twoich danych będziemy my: Portal Laboratoria.net z siedzibą w Krakowie (Grupa INTS ul. Czerwone Maki 55/25 30-392 Kraków).

O jakich danych mówimy?

Chodzi o dane osobowe, które są zbierane w ramach korzystania przez Ciebie z naszych usług w tym zapisywanych w plikach cookies.

Dlaczego chcemy przetwarzać Twoje dane?

Przetwarzamy te dane w celach opisanych w polityce prywatności, między innymi aby:

Komu możemy przekazać dane?

Zgodnie z obowiązującym prawem Twoje dane możemy przekazywać podmiotom przetwarzającym je na nasze zlecenie, np. agencjom marketingowym, podwykonawcom naszych usług oraz podmiotom uprawnionym do uzyskania danych na podstawie obowiązującego prawa np. sądom lub organom ścigania – oczywiście tylko gdy wystąpią z żądaniem w oparciu o stosowną podstawę prawną.

Jakie masz prawa w stosunku do Twoich danych?

Masz między innymi prawo do żądania dostępu do danych, sprostowania, usunięcia lub ograniczenia ich przetwarzania. Możesz także wycofać zgodę na przetwarzanie danych osobowych, zgłosić sprzeciw oraz skorzystać z innych praw.

Jakie są podstawy prawne przetwarzania Twoich danych?

Każde przetwarzanie Twoich danych musi być oparte na właściwej, zgodnej z obowiązującymi przepisami, podstawie prawnej. Podstawą prawną przetwarzania Twoich danych w celu świadczenia usług, w tym dopasowywania ich do Twoich zainteresowań, analizowania ich i udoskonalania oraz zapewniania ich bezpieczeństwa jest niezbędność do wykonania umów o ich świadczenie (tymi umowami są zazwyczaj regulaminy lub podobne dokumenty dostępne w usługach, z których korzystasz). Taką podstawą prawną dla pomiarów statystycznych i marketingu własnego administratorów jest tzw. uzasadniony interes administratora. Przetwarzanie Twoich danych w celach marketingowych podmiotów trzecich będzie odbywać się na podstawie Twojej dobrowolnej zgody.

Dlatego też proszę zaznacz przycisk "zgadzam się" jeżeli zgadzasz się na przetwarzanie Twoich danych osobowych zbieranych w ramach korzystania przez ze mnie z portalu *Laboratoria.net, udostępnianych zarówno w wersji "desktop", jak i "mobile", w tym także zbieranych w tzw. plikach cookies. Wyrażenie zgody jest dobrowolne i możesz ją w dowolnym momencie wycofać.
 
Więcej w naszej POLITYCE PRYWATNOŚCI
 

Newsletter

Zawsze aktualne informacje