|
Zamknij X
|
Otrzymywanie sond
Sondy DNA wykorzystywane w technice mikromacierzy cDNA otrzymywane są na drodze powielania (tj. amplifikacji) fragmentów DNA za pomocą reakcji PCR. Materiał genetyczny powielany jest z wykorzystaniem specyficznych enzymów. W reakcji otrzymywania sond stosuje się odwrotny PCR (tzw. RT-PCR), w którym wystarczy zaprojektować odpowiednie startery do selektywnej i wydajnej replikacji wybranych części genów. W technice tej nie ma konieczności poznania całej sekwencji nukleotydowej sondy. Otrzymane sondy DNA oraz przygotowane z nich macierze charakteryzują się niską specyficznością wobec genów homologicznych. Wynika to z faktu, iż sonda zbudowana z kilkuset nukleotydów może przyłączyć fragment danej sekwencji DNA, która jest komplementarna na krótkim odcinku sekwencji) [5].
Zupełnie inaczej sprawa wygląda w przypadku sond oligonukleotydowych, których przygotowanie wymaga poznania praktycznie całej sekwencji genomu. Sondy oligonukleotydowe projektowane są w taki sposób, aby były całkowicie komplementarne do odcinka badanego genu. Aby reakcja cechowała się dużą swoistością, projektuje się kilkanaście sond DNA, które dają możliwość przyłączania z różnymi rejonami odpowiedniego genu [5].
Autor: Zuzanna Koperwas
Literatura:
[1]. Stępniak P., Handschuh L., Figlerowicz M., 2008. Mikromacierze DNA- analiza danych. Biotechnologia 4 (83) 68-87, 2008. http://www.pfb.info.pl/files/kwartalnik/4_2008/05.%20stepniak-figlerowicz.pdf
[2]. Szutowicz A., Raszei-Szpecht A., 2009. Diagnostyka laboratoryjna. Tom I. Gdański Uniwersytet Medyczny, Zlecenie KW/224/09.Recenzent prof. dr hab.Wiesława Łysiak-Szydłowska. S.267-269.
[3]. https://www.genome.gov/10000533/dna-microarray-technology/
[4]. Kisiel A., Skąpska A., Markiewicz W.T., Figlerowicz M., 2004. Mikromacierze DNA. KOSMOS Problemy Nauk Biologicznych, Tom 53, Numer 3-4 (264-265), Strony 295-303. http://kosmos.icm.edu.pl/PDF/2004/295.pdf
[5]. Kazula A., 2009. Wykorzystanie mikromacierzy DNA w terapii i diagnostyce. Genetyka, tom 65, nr 3. http://www.ptfarm.pl/pub/File/FP/3_2009/14%20%20mikromacierze.pdf
[6]. Jarząb B., Gubała E., Lange D., 2004. Mikromacierze DNA i profil ekspresji genów raka brodawkowatego tarczycy. IV Konferencja Sekcji Endokrynologii Molekularnej PTE, Poznań, 2-3.10.2004.
[7]. Ludwików A., Krasowski K., Misztal L.H., Sadowski J., 2008. Mikromacierze DNA i ich zastosowanie w badaniach ekspresji genów u roślin. BIOTECHNOLOGIA 4 (83), 131-143, 2008. http://www.pfb.info.pl/files/kwartalnik/4_2008/09.%20ludwikow-krasowski.pdf
[8]. http://www.cellab.polsl.pl/resources/Rozprawa_doktorska_Jaksik.pdf
[9]. Brzeszcz J., Kapusta P., Turkiewicz A., 2013. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach bioremediacji substancji ropopochodnych. NAFTA-GAZ, ROK LXIX, Nr 11/2013. http://archiwum.inig.pl/inst/nafta-gaz/nafta-gaz/Nafta-Gaz-2013-11-04.pdf
[10]. http://www.premierbiosoft.com/tech_notes/microarray.html
[11]. https://bio.as.uky.edu/sites/default/files/Overview%20of%20DNA%20microarrays.pdf
[12]. Formanowicz P., Urbaniak R., Handschuh L., Formanowicz D., Figlerowicz M., 2008. Mikromacierze DNA- zasady projektowania sond. BIOTECHNOLOGIA 4 (83) 54-67, 2008. Prace przeglądowe. http://www.pfb.info.pl/files/kwartalnik/4_2008/04.%20formanowicz-urbaniak.pdf
[13]. Żmieńsko A., Handschuh L., Góralski M., Figlerowicz M., 2008. Zastosowanie mikromacierzy DNA w genomice strukturalnej i funkcjonalnej. BIOTECHNOLOGIA 4 (83) 39-53, 2008. Prace przeglądowe. http://www.pfb.info.pl/files/kwartalnik/4_2008/03.%20zmienko-handschuh.pdf
25 maja 2018 roku zacznie obowiązywać Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r (RODO). Potrzebujemy Twojej zgody na przetwarzanie Twoich danych osobowych przechowywanych w plikach cookies. Poniżej znajdziesz pełny zakres informacji na ten temat.
Zgadzam się na przechowywanie na urządzeniu, z którego korzystam tzw. plików cookies oraz na przetwarzanie moich danych osobowych pozostawianych w czasie korzystania przeze mnie ze strony internetowej Laboratoria.net w celach marketingowych, w tym na profilowanie i w celach analitycznych.
Administratorami Twoich danych będziemy my: Portal Laboratoria.net z siedzibą w Krakowie (Grupa INTS ul. Czerwone Maki 55/25 30-392 Kraków).
Chodzi o dane osobowe, które są zbierane w ramach korzystania przez Ciebie z naszych usług w tym zapisywanych w plikach cookies.
Przetwarzamy te dane w celach opisanych w polityce prywatności, między innymi aby:
dopasować treści stron i ich tematykę, w tym tematykę ukazujących się tam materiałów do Twoich zainteresowań,
dokonywać pomiarów, które pozwalają nam udoskonalać nasze usługi i sprawić, że będą maksymalnie odpowiadać Twoim potrzebom,
pokazywać Ci reklamy dopasowane do Twoich potrzeb i zainteresowań.
Zgodnie z obowiązującym prawem Twoje dane możemy przekazywać podmiotom przetwarzającym je na nasze zlecenie, np. agencjom marketingowym, podwykonawcom naszych usług oraz podmiotom uprawnionym do uzyskania danych na podstawie obowiązującego prawa np. sądom lub organom ścigania – oczywiście tylko gdy wystąpią z żądaniem w oparciu o stosowną podstawę prawną.
Masz między innymi prawo do żądania dostępu do danych, sprostowania, usunięcia lub ograniczenia ich przetwarzania. Możesz także wycofać zgodę na przetwarzanie danych osobowych, zgłosić sprzeciw oraz skorzystać z innych praw.
Każde przetwarzanie Twoich danych musi być oparte na właściwej, zgodnej z obowiązującymi przepisami, podstawie prawnej. Podstawą prawną przetwarzania Twoich danych w celu świadczenia usług, w tym dopasowywania ich do Twoich zainteresowań, analizowania ich i udoskonalania oraz zapewniania ich bezpieczeństwa jest niezbędność do wykonania umów o ich świadczenie (tymi umowami są zazwyczaj regulaminy lub podobne dokumenty dostępne w usługach, z których korzystasz). Taką podstawą prawną dla pomiarów statystycznych i marketingu własnego administratorów jest tzw. uzasadniony interes administratora. Przetwarzanie Twoich danych w celach marketingowych podmiotów trzecich będzie odbywać się na podstawie Twojej dobrowolnej zgody.
Dlatego też proszę zaznacz przycisk "zgadzam się" jeżeli zgadzasz się na przetwarzanie Twoich danych osobowych zbieranych w ramach korzystania przez ze mnie z portalu *Laboratoria.net, udostępnianych zarówno w wersji "desktop", jak i "mobile", w tym także zbieranych w tzw. plikach cookies. Wyrażenie zgody jest dobrowolne i możesz ją w dowolnym momencie wycofać.
Więcej w naszej POLITYCE PRYWATNOŚCI
Recenzje