Akceptuję
W ramach naszej witryny stosujemy pliki cookies w celu świadczenia państwu usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczone w Państwa urządzeniu końcowym. Możecie Państwo dokonać w każdym czasie zmiany ustawień dotyczących cookies. Więcej szczegółów w naszej Polityce Prywatności

Zamknij X
Strona główna Artykuły
Dodatkowy u góry
Labro na dole

Technika mikromacierzy DNA

Badania wykorzystywane w biologii molekularnej ewoluowały poprzez rozwój technologii wykorzystywanych do ich realizacji. Mikromacierze DNA są jedną z takich technologii, która pozwala naukowcom badać i zajmować się kwestiami, które kiedyś były uważane za nie identyfikowalne. Technika ta umożliwiła zrozumieć podstawowe aspekty podkreślające wzrost i rozwój życia, a także zbadać przyczyny anomalii genetycznych występujących w funkcjonującym organizmie człowieka [10].

 

Mikromacierze (znane również jako macierze DNA, chipy DNA lub biochipy) zaliczane są do wyjątkowo interesujących narzędzi współczesnej biologii molekularnej. Technologia ta stanowi jedno z najważniejszych osiągnięć w eksperymentalnej biologii molekularnej [11]. 

Decydujący w tym podejściu jest nie tylko fakt szerokiego spektrum zastosowań metody (w tym do analizy struktury genomu, profilu ekspresji genów, genotypowania czy sekwencjonowanie), lecz również z uwagi na możliwość jednoczesnego badania bardzo dużej liczby obiektów. Informacje zdobyte w trakcie eksperymentu z zastosowaniem mikromacierzy wymagają zastosowania bardzo zaawansowanych metod bioinformatycznych, które ostatecznie ujawniają wyniki badanych prób [1].

Idea wdrożenia techniki mikromacierzy narodziła się jeszcze w latach 80-tych, po odkryciu łańcuchowej reakcji polimeryzacji (PCR). Pionierem w badaniach był P. Brown i wsp., którzy udoskonalili technikę pod kątem precyzji i powtarzalności wyników uzyskiwanych przy zastosowaniu mikromacierzy cDNA. W metodzie obniżyli również wymagane ilości mRNA niezbędnego do otrzymania powtarzalnych wyników. Jednakże z uwagi na wysokie koszty, wdrożenie techniki w badaniach molekularnych następowało bardzo powoli, a przełom dokonał się w 1999 r. po opublikowaniu w czasopiśmie „Science” pracy poświęconej profilowi molekularnemu blastów białaczkowych. W pracy wykazano, że z wykorzystaniem mikromacierzy możliwe jest odróżnienie ostrej białaczki szpikowej od białaczki limfoblastycznej (w oparciu o dane dotyczące ekspresji odpowiednich genów, których jest kilkadziesiąt) [5]. Zastosowane mikromacierze (produkowane przez firmę Affymetrix, posiadającą patent na tę technologię) nazwano mikromacierzami oligonukleotydowymi wysokiej gęstości lub chipami DNA [6].

 

Mikromacierze DNA

 

Mikromacierze DNA są zbiorem punktów mikroskopowych fragmentów DNA, które stanowią pojedyncze geny, ułożone na stałej powierzchni poprzez kowalencyjne wiązanie do chemicznie odpowiedniej matrycy [5]. Mikromacierze są miniaturowymi układami hybrydyzacyjnymi w skład, których wchodzą sondy specyficznie rozpoznające fragmenty poszczególnych genów/ transkryptów. Wykorzystywane są zarówno do analizy strukturalnej jak i funkcjonalnej genomu, dzięki czemu znajdują liczne zastosowania w wielu dziedzinach biologii i medycyny [12].

Zastosowanie mikromacierzy umożliwia jednoczesne śledzenie tysięcy reakcji molekularnych, które zachodzą na płytkach mniejszych niż standardowo wykorzystywane szkiełka przykrywkowe [5].

Pod kątem budowy, mikromacierze zbudowane są z oligonukleotydów o długości kilkudziesięciu par zasad przytwierdzonych do powierzchni szklanej płytki. Technologia produkcji mikromacierzy jest bardzo zbliżona do produkcji nowoczesnych procesorów wykorzystywanych w komputerach osobistych. W trakcie procesu produkcji stosowane są odpowiednie maski fotolitograficzne, które umożliwiają przyłączanie pojedynczych nukleotydów określonego rodzaju w obszarach macierzy oświetlonych światłem UV. Technologia ta pozwala na zbudowanie mikromacierzy zawierającej setki tysięcy różnych oligonukleotydów, które są specyficzne dla różnych fragmentów DNA lub RNA, zgrupowanych w punktach macierzy zwanych sondami [8]. 

 


Tagi: mikromacierze, oligonukleotydy, sondy, otwrotna transkrypcja, PCR
Drukuj PDF
wstecz Podziel się ze znajomymi

Recenzje



Informacje dnia: Niemal 3,2 mln zł dla 77 badaczy w konkursie MINIATURA 5 Obecnie trzecia dawka szczepionki nie dla każdego Naukowcy coraz lepiej rozumieją wpływ SARS-CoV-2 na organizm Dodatek cukru usprawnił baterie Jest prawdopodobne, że szczepionki przeciw COVID-19 będziemy brać co roku Mobilna instalacja artystyczna inspirowana zjawiskami fizyki kwantowej Niemal 3,2 mln zł dla 77 badaczy w konkursie MINIATURA 5 Obecnie trzecia dawka szczepionki nie dla każdego Naukowcy coraz lepiej rozumieją wpływ SARS-CoV-2 na organizm Dodatek cukru usprawnił baterie Jest prawdopodobne, że szczepionki przeciw COVID-19 będziemy brać co roku Mobilna instalacja artystyczna inspirowana zjawiskami fizyki kwantowej Niemal 3,2 mln zł dla 77 badaczy w konkursie MINIATURA 5 Obecnie trzecia dawka szczepionki nie dla każdego Naukowcy coraz lepiej rozumieją wpływ SARS-CoV-2 na organizm Dodatek cukru usprawnił baterie Jest prawdopodobne, że szczepionki przeciw COVID-19 będziemy brać co roku Mobilna instalacja artystyczna inspirowana zjawiskami fizyki kwantowej

Partnerzy

GoldenLine Fundacja Kobiety Nauki Job24 Obywatele Nauki NeuroSkoki Portal MaterialyInzynierskie.pl Uni Gdansk MULTITRAIN I MULTITRAIN II Nauki przyrodnicze KOŁO INZYNIERÓW PB ICHF PAN FUNDACJA JWP NEURONAUKA Mlodym Okiem Polski Instytut Rozwoju Biznesu Analityka Nauka w Polsce CITTRU - Centrum Innowacji, Transferu Technologii i Rozwoju Uniwersytetu Akademia PAN Chemia i Biznes Farmacom Świat Chemii Forum Akademickie Biotechnologia     Bioszkolenia Geodezja Instytut Lotnictwa EuroLab

Szanowny Czytelniku!

 
25 maja 2018 roku zacznie obowiązywać Rozporządzenie Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r (RODO). Potrzebujemy Twojej zgody na przetwarzanie Twoich danych osobowych przechowywanych w plikach cookies. Poniżej znajdziesz pełny zakres informacji na ten temat.
 
Zgadzam się na przechowywanie na urządzeniu, z którego korzystam tzw. plików cookies oraz na przetwarzanie moich danych osobowych pozostawianych w czasie korzystania przeze mnie ze strony internetowej Laboratoria.net w celach marketingowych, w tym na profilowanie i w celach analitycznych.

Kto będzie administratorem Twoich danych?

Administratorami Twoich danych będziemy my: Portal Laboratoria.net z siedzibą w Krakowie (Grupa INTS ul. Czerwone Maki 55/25 30-392 Kraków).

O jakich danych mówimy?

Chodzi o dane osobowe, które są zbierane w ramach korzystania przez Ciebie z naszych usług w tym zapisywanych w plikach cookies.

Dlaczego chcemy przetwarzać Twoje dane?

Przetwarzamy te dane w celach opisanych w polityce prywatności, między innymi aby:

Komu możemy przekazać dane?

Zgodnie z obowiązującym prawem Twoje dane możemy przekazywać podmiotom przetwarzającym je na nasze zlecenie, np. agencjom marketingowym, podwykonawcom naszych usług oraz podmiotom uprawnionym do uzyskania danych na podstawie obowiązującego prawa np. sądom lub organom ścigania – oczywiście tylko gdy wystąpią z żądaniem w oparciu o stosowną podstawę prawną.

Jakie masz prawa w stosunku do Twoich danych?

Masz między innymi prawo do żądania dostępu do danych, sprostowania, usunięcia lub ograniczenia ich przetwarzania. Możesz także wycofać zgodę na przetwarzanie danych osobowych, zgłosić sprzeciw oraz skorzystać z innych praw.

Jakie są podstawy prawne przetwarzania Twoich danych?

Każde przetwarzanie Twoich danych musi być oparte na właściwej, zgodnej z obowiązującymi przepisami, podstawie prawnej. Podstawą prawną przetwarzania Twoich danych w celu świadczenia usług, w tym dopasowywania ich do Twoich zainteresowań, analizowania ich i udoskonalania oraz zapewniania ich bezpieczeństwa jest niezbędność do wykonania umów o ich świadczenie (tymi umowami są zazwyczaj regulaminy lub podobne dokumenty dostępne w usługach, z których korzystasz). Taką podstawą prawną dla pomiarów statystycznych i marketingu własnego administratorów jest tzw. uzasadniony interes administratora. Przetwarzanie Twoich danych w celach marketingowych podmiotów trzecich będzie odbywać się na podstawie Twojej dobrowolnej zgody.

Dlatego też proszę zaznacz przycisk "zgadzam się" jeżeli zgadzasz się na przetwarzanie Twoich danych osobowych zbieranych w ramach korzystania przez ze mnie z portalu *Laboratoria.net, udostępnianych zarówno w wersji "desktop", jak i "mobile", w tym także zbieranych w tzw. plikach cookies. Wyrażenie zgody jest dobrowolne i możesz ją w dowolnym momencie wycofać.
 
Więcej w naszej POLITYCE PRYWATNOŚCI
 

Newsletter

Zawsze aktualne informacje